1945年10月,科尔沁左翼中旗(即东科中旗)民主政府在巴彦塔拉成立,隶属于科尔沁左翼前、中、后三旗联合办事处。1946年3月,东科中旗隶属于东蒙古人民自治政府所辖哲里木省;6月隶属于改建的哲里木盟(今通辽市)。
1946年5月—1947年4月期间,由于战争原因,旗政府驻地曾数次迁移(1946年5—8月,先迁至乌斯吐,今乌斯吐苏木;又迁驻库里根庙,今通辽市大林镇内;又迁驻架玛吐,今架玛吐镇;9月,迁驻舍伯吐,今舍伯吐镇;10月,再迁驻架玛吐,今架玛吐镇;1947年4月,再迁驻舍伯吐,今舍伯吐镇)。
1947年5—9月,东科中旗由辽吉省管辖;1947年9月—1949年4月,由辽北省管辖。