1949年4月21日。东科中旗随哲里木盟(今通辽市)划归内蒙古自治政府管辖,同时将东科中旗正式恢复科尔沁左翼中旗。1948年3月10日,旗政府再次迁驻架玛吐;1950年7月,经内蒙古自治区人民政府批准,科尔沁左翼中旗人民政府迁驻巴彦塔拉(今巴彦塔拉镇)。
1953年1月,科尔沁左翼中旗归属内蒙古自治区东部区行政公署管辖;1954年5月,归属哲里木盟。1956年2月23日,国务院批准,将吉林省长岭县保康镇划归科尔沁左翼中旗管辖。同年11月,科尔沁左翼中旗人民委员会迁驻宝康镇。1969年7月5日,科尔沁左翼中旗随哲里木盟划归吉林省管辖;1979年5月30日,划回内蒙古自治区仍归哲里木盟管辖。
1984年,科尔沁左翼中旗人大常委会和人民政府在全旗进行了“改社建乡”体制改革,取消人民公社,分别改建镇、苏木、乡人民代表大会和人民政府。